Wir nennen DNA-Rohdaten die Informationen, die aus einer DNA-Probe in unserem Labor extrahiert wurden. Der MyHeritage-DNA-Test produziert ungefähr 700.000 Daten, die sowohl von der väterlichen als auch von der mütterlichen Seite vererbt wurden. Diese Daten werden verwendet, um Ihre Ethnizitätsschätzung zu bestimmen und
DNA-Matches zu berechnen.
DNA- Rohdaten werden in einer durch Tabulatoren getrennten Textdatei bereitgestellt. Diese Datei enthält eine Kopfzeile, die die Daten beschreibt, und eine Zeile für jede Variante mit fünf Spalten, die folgende Informationen enthalten:
- der Name der Variante mit ihrer rsID (= Referenz-SNP-Cluster-ID), falls verfügbar
- die Chromosomenzahl
- die Variantenposition auf dem Chromosom
- das Paar der beobachteten Werte (Allel 1 und Allel 2 - die die väterliche und mütterliche Seite darstellt, nicht notwendigerweise in dieser Reihenfolge) an dieser Stelle im Genom für diese spezifische DNA-Probe.
Hier ist ein Beispiel, wie DNA-Rohdaten aussehen:
rsID | Chromosome | Position | Allele 1 | Allele 2 |
rs4577212 | 1 | 79017 | C | C |
rs3094325 | 1 | 742429 | A | A |
rs3931972 | 1 | 742884 | G | G |
rs12164819 | 1 | 766439 | T | T |
Rohdaten umfassen zwei Arten von genetischen Varianten in Ihrer DNA: die SNPs (steht für Single Nucleotide Polymorphisms) und die Indels (Insertion und / oder Deletion von Nukleotiden).
- Für SNP-Varianten wird jedes Allel durch einen Buchstaben dargestellt, der für die 4 DNA-Nukleotide steht:
A für Adenin
C für Cytosin
G für Guanin
T für Thymin
- Für indelische Varianten wird jedes Allel durch die Buchstaben I oder D dargestellt, die für Insertion oder Deletion stehen.
Jede SNP-Position kann eine Kombination von zwei Nukleotiden von den vier Nukleotiden (A, C, G und T) aufweisen. Dies bedeutet, dass es für jede Variante drei Möglichkeiten von Genotypen gibt. Zum Beispiel: Wenn eine Variante entweder G (Guanin) oder C (Cytosin) enthält, dann sind die möglichen Genotypen G G, C C oder G C (die Reihenfolge der Allele spielt keine Rolle, daher ist G C dasselbe wie C G).
Jedes Chromosom besteht aus 2 Strängen, die üblicherweise als "Vorwärtsstrang" und "Rückwärtsstrang" bezeichnet werden. Allele können auf einem dieser beiden Stränge liegen.
Zum Beispiel wird ein SNP-Genotyp, der A A auf dem "Vorwärtsstrang" ist, T T auf dem "Rückwärtsstrang" sein.
Es ist wichtig zu wissen, in welchem Strang sich Ihre Daten befinden. MyHeritage DNA übermitelt Daten für die SNPs, die sich auf dem Vorwärtsstrang befinden in Bezug auf das menschliche Referenzgenom.